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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  36 lines
  1. ***********************
  2. * Myotoxins signature *
  3. ***********************
  4.  
  5. Myotoxins [1] are small basic  peptides (42 to 45 residues) from  the venom of
  6. rattlesnakes that  cause severe  muscle necrosis by a non-enzymatic mechanism.
  7. Myotoxins act  extremely  rapidly  and serve two primary biological functions:
  8. limiting the  flight  of  prey by causing instantaneous  paralysis of the hind
  9. limbs and promoting rapid death by paralysis of the diaphragm.
  10.  
  11. Myotoxins contain six cysteines involved in three disulfide bonds  as shown in
  12. the following schematic representation:
  13.  
  14.                     +------------------+
  15.                     |                  |
  16.           x+xC+x+xx+Cxx+xxxCxxxxxxxx+xxCxx+x+CC++xxxxxx
  17.              |             |                 ||
  18.              +-------------|-----------------+|
  19.                            +------------------+
  20.  
  21. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  22. '+': conserved basic residue (Arg, Lys, or His).
  23.  
  24. The structure  of all known myotoxins is very conserved. We chose  to  build a
  25. pattern based  solely  on  the  position  of  conserved  cysteines  and  basic
  26. residues.
  27.  
  28. -Consensus pattern: K-x-C-H-x-K-x(2)-H-C-x(2)-K-x(3)-C-x(8)-K-x(2)-C-x(2)-
  29.                     [RK]-x-K-C-C-K-K
  30. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32. -Last update: June 1992 / Pattern and text revised.
  33.  
  34. [ 1] Griffin P.R., Aird S.D.
  35.      FEBS Lett. 274:43-47(1990).
  36.